La storia del museo del Vino a Bordeaux prende il conto alla rovescia nella seconda metà del XVIII secolo – dal momento in cui l'Accademia di Bordeaux, è stato fondato il museo di sculture in pietra, in cui c'erano i resti di un patrimonio di roma. Questi reperti sono stati trovati durante i lavori di scavo nei pressi della città, che vengono periodicamente effettuati nel periodo dal XVI al XVIII secolo.

Nel 1963 istituzione è stato rinominato come il museo di storia, di archeologia e etnografia, e divenne noto sotto il nome di «museo del Vino». Nel 1987 il museo si trasferì nell'edificio ex facoltà di lettere e di scienza, che è stato costruito alla fine del XIX secolo sul luogo di un monastero, famoso come luogo di sepoltura, scrittore e filosofo Michel de Montaigne. Il museo del Louvre si trova a pochi passi dal duomo di Sant'Andrea.

Nel 2009 nel museo sono aperte nuove sale dedicate a tale argomento complesso nella storia coloniale della Francia, come la schiavitù e la tratta di esseri umani. Bordeaux era il secondo dopo il Nantes, il porto, attraverso il quale in Europa arrivavano i neri schiavi. A Bordeaux, è stato consegnato circa 130 migliaia di schiavi. Nel museo sono presentati documenti e altri reperti che raccontano le condizioni di vita e di lavoro degli schiavi, punizioni per le ribellioni e i germogli.

Attualmente l'area del museo è di oltre 5.000 metri quadrati, e la raccolta di reperti che conta circa 70 mila unità di storage. Tutti questi oggetti, documenti, opere d'arte rappresentano la storia la storica regione di Aquitania e il suo principale della città di Bordeaux. I primi reperti di questa collezione risalgono all'epoca preistorica, molti degli oggetti esposti sono le testimonianze di varie età – romane, раннехристианских, il Medioevo. Nel museo è possibile vedere la mostra sulla storia navale Bordeaux, l'arte dei popoli dell'Africa e dell'Oceania.