Di fronte all'ingresso principale della fortezza si trova il museo Archeologico della città di Rethymno. I manufatti esposti al museo, rappresentano la storia di tutta la regione, dal neolitico e fino al periodo romano. L'esposizione è presentata in ordine cronologico.

Il museo archeologico di Rethymno è stata fondata nel 1887. Dal 1991 il museo occupa un turco del bastione. Bene un edificio fortificato garantendogli una protezione supplementare centrale di accesso alla fortezza. Fino al 1960 la costruzione fu utilizzata come prigione statale. In precedenza, il museo si trovava in un palazzo Loggia veneziana.

Esposizione del museo è ampia e variegata. Nel museo sono: grande collezione di ceramiche, sculture, statuette, una varietà funebri, manufatti, gioielli, utensili domestici, romani, infissi, articoli in pietra, strumenti di lavoro e molto altro ancora.

I più interessanti mostre del museo si riferiscono позднеминойские tomba, statuette di terracotta, casco позднеминойской epoca, la stampa di Monastiraki, decorazioni in pietra delle grotte Гераниу. Impressionanti sono pezzi come numeri copia della statua di «Grande геркуланка» dell'antica città di Элефтерна, statua in marmo di Afrodite (1 secolo e cartagine), minoan statuetta della dea con le braccia alzate, trovato in Панкалохори (1320-1200 a.c.), testa femminile figurine di terracotta di Аксоса (530 anno a.c.). Di particolare interesse rappresenta anche una straordinaria collezione di monete di diversi periodi e regioni, tra cui monete, чеканившиеся di Cnosso. Nel museo è possibile vedere in marmo надгробную stele con l'immagine di un guerriero, trovata in Элефтерне, che risale alla seconda metà del 6 secolo a.c. e il sarcofago di marmo raffiguranti scene mitologiche I-III secolo cartagine

La ricca collezione del museo Archeologico non lascia indifferenti anche искушенного amante della storia.