Lo zoo e il museo della natura a Spalato apparve per la presentato alla città all'inizio del XX secolo più naturali preziose collezioni. Il professor Umberto Джирометта nel 1923 pose il problema di creare un Museo di storia naturale. Il consiglio comunale di Spalato ha preso la questione alla considerazione e nel 1924 fu fondato il primo museo, e Джирометта è diventato il suo capo fino alla sua morte nel 1939.

Nei primi anni della sua esistenza, il museo si trovava in uno degli edifici comunali nel cuore della città. Presto interno energetiche, e il museo trasferito in uno degli edifici del parco Marjan. Oltre al museo è stato aperto un piccolo zoo, che rappresentava alcuni tipi di locali e di animali esotici. Per prima sul territorio della ex Jugoslavia Acquario accanto all'edificio del museo è stato costruito e ulteriore spazio. Alcuni anni dopo, l'Acquario è stato chiuso e trasformato in un piccolo terrario. Oggi lo zoo a Spalato conta più di 300 specie di animali.

L'edificio nel parco Marjan in tempo di guerra del 1991 è stato chiuso per motivi di sicurezza. Poi il museo si è trasferito nella fortezza Грипе, e dopo il 1997 è tornato di Marjan. Dopo il 2000, su richiesta dei lavoratori, per le esigenze del Museo è stato assegnato un nuovo spazio, una superficie totale di circa 1156 mq, in cui il Museo ha iniziato a lavorare nel mese di gennaio 2002.

Prima di aprire il nuovo direttore del museo è stata effettuata la riorganizzazione del museo, переучтены raccolta e aggiunta di alcune nuove esposizioni (ad esempio, una collezione di animali riempiti e di penna, dipartimento di geologia e paleontologia, entomologia, dipartimento di vertebrati e invertebrati, ecc.). Inoltre sono stati effettuati lavori di elaborazione e organizzazione di mostre, la ricerca sul campo nella parte centrale della Dalmazia, le numerose mostre a tema al museo e al di fuori di esso. Inoltre, il personale del Museo sono coinvolti in numerosi convegni scientifici.

Al primo piano del museo ospita varie mostre a tema, mentre i restanti piani di riferimento esposizioni permanenti. Chiunque può acquistare presso il museo di ulteriori risorse a museo di storia locale e di storia naturale.