Universita ' di zagabria è il più vecchio, non solo in Croazia, ma anche nel Sud-Est Europa. La data ufficiale di fondazione è di 23 settembre 1669, quando l'imperatore romano e ungherese-croato re Leopoldo I emanato una legge, признающий i privilegi e lo status universitario di istituto di istruzione ex gesuita accademia, che ha operato sul territorio libero della città reale di Zagabria, l'ex capitale del Regno di Croazia e Slavonia. Questa data è l'inizio di una storia l'università di zagabria nella sua lotta per mettere in pratica ricevuti diritti e ottenere un posto decente tra autorevoli e rappresentative di università e accademie in Europa Centrale.

La storia l'università di zagabria nel moderno, la sua forma inizia con le iniziative джяковского del vescovo e di spicco croato мецената Йосипа Юрая Штроссмайера, quando nel 1861, ha proposto di organizzare presso l'università di quattro facoltà: la facoltà di medicina, teologico, filosofico e giuridico. Questa offerta è stata considerata nel giro di pochi anni, e nel 1874 il parlamento croato ha preso questa iniziativa e ha emesso un decreto Sull'università». Nello stesso anno l'università ha cambiato nome ed è stato chiamato da una Moderna all'università di Zagabria.

Dal 1990 l'università, è stata ottenuta la grande autonomia, allo stesso tempo, ha iniziato l'adesione al processo di Bologna.